Az emberi mikrobiom Harrison

Jogi nyilatkozat: Ezeket az idézeteket a kapott információk alapján automatikusan állítottuk elő, és nem biztos, hogy 100% -ban pontosak. Ha bármilyen kérdése van a formázási pontossággal kapcsolatban, olvassa el a hivatalos stíluskézikönyvet.

mikrobiom

Hivatkozási fájl letöltése:

Fejezet tartalma
  • BEVEZETÉS
  • ESZKÖZÖK AZ EMBER MIKROBIÁLIS KÖZÖSSÉGEK METAGENOMIKAI ELEMZÉSÉHEZ
  • ÖKOLÓGIAI ELVEK ÉS PARAMÉTEREK A MIKRÓBIAI KÖZÖSSÉGEK ÖSSZEHASONLÍTÁSÁHOZ
  • AZ OKOSI KAPCSOLATOK MEGHATÁROZÁSA BELBENI MIKROBIÓTA, NORMÁL FIZIOLÓGIAI, METABOLIKUS ÉS IMMUNOLÓGIAI FENOTÍPUSOK KÖZÖTT, BETEGSÉGÜGYEKBEN
  • ELŐREHALAD
  • ABSZTRAKT
  • Teljes fejezet
  • Ábrák
  • Kép
  • Videók
  • További források

BEVEZETÉS

Az emberi genom megfejtését lehetővé tevő technológiák forradalmasították azon képességünket, hogy meghatározzuk a testünket gyarmatosító és mikrobiotát alkotó mikrobaközösségek összetételét és funkcióit.. Minden test élőhelye, beleértve a bőrt, az orrot, a szájat, a légutakat, az emésztőrendszert és a hüvelyt, megkülönböztető mikrobaközösséget tartalmaz. Erőfeszítések a mikrobiota és a mikrobiális gének gyűjtésének megértésére (mikrobiomunk) megváltoztatják az "én" nézetünket, és elmélyítik a normális fiziológiai, metabolikus és immunjellemzők megértését, valamint azok interperszonális és intraperszonális variációit. Ezenkívül ez a kutatási terület új perspektívát kínál a már ismert mikrobiális „járulékos” betegségekről, és új kezelési és megelőzési stratégiákat javasol. Az emberi mikrobiom felülvizsgálatában használt legfontosabb kifejezéseket a 86e-1. Táblázat határozza meg.

Az emberi mikrobiómák megvitatásában használt kifejezések szótára

Az emberi mikrobiómák megvitatásában használt kifejezések szótára

Terméstől független elemzés

Az elemzés olyan típusa, amelyben a mikrobák tenyésztése nem szükséges, de az információkat közvetlenül a környezeti mintákból nyerik ki

Sokszínűség (alfa és béta)

Alfa sokféleség méri a fajok (élőlénytípusok) tényleges számát élőhelyek, helyszínek vagy egyedi minták szintjén. Béta változatosság méri az élőhelyek, helyszínek vagy minták közötti organizmustípusok számának különbségeit

Az élet területei

A földi élet három fő királysága: Eucarya (az embereket is beleértve), a baktériumok és az Archaea

Bármely káros állapot, amely a gazdaszervezetek egy vagy több mikrobiális közösségében bekövetkező strukturális vagy funkcionális rendellenességből vagy mindkettőből adódik

Az állatok nevelése steril (csíramentes) körülmények között. Ezeket az állatokat később az életciklus különböző szakaszaiban megtelepíthetik meghatározott mikrobák gyűjtésével.

A gazdaszervezetből és annak összes belső és külső szimbiontjából, génkészletükből és funkcióikból álló biológiai entitás

Az ökológiában a biom az élőhelyre és a benne található organizmusokra utal. Ebben az értelemben a mikrobiom Az embert az emberi testhez kapcsolódó mikroorganizmusok gyűjteményeként definiálnák. A mikrobiom kifejezés azonban az adott mikrobiota (lásd alább a „Mikrobiota”) tagjaiban jelenlévő genomok és gének együttesére és a metagenómára is utal. Az ember az emberi genom és a mikrobiális gének (mikrobiom) összege. Központi emberi mikrobiom ez úgy definiálható, mint minden, ami egy adott testhelyen megoszlik az emberi mikrobiomák egésze vagy túlnyomó többsége között. A magmikrobiom tartalmazhat közös genom- és génkészletet, amelyek különféle fehérjecsaládokat vagy metabolikus kapacitásokat, vagy mindkettőt kódolják. A különböző emberekben változóan képviselt mikrobiális gének hozzájárulhatnak a jellemző fiziológiai vagy metabolikus fenotípusok kialakulásához

Egy feltörekvő terület, amely a mikrobaközösségek szerkezetének és funkcióinak növényfüggetlen vizsgálatát, valamint e közösségek és az általuk elfoglalt élőhelyek közötti kölcsönhatásokat tartalmazza. A metagenomika magában foglalja 1) az adott környezetből közvetlenül izolált mikrobiális DNS sörétes szekvenálását és 2) klónozott közösségekből származó DNS-ből összeállított expressziós könyvtárak nagy áteresztőképességű szkrínelését olyan specifikus funkciók azonosítására, mint az antibiotikum-rezisztencia (funkcionális metagenomika)). A DNS-szintű elemzés megalapozza a mikrobiom által termelt mRNS és fehérjék profilozását (metatranscriptomics és a metaproteomika) és egy közösségi anyagcsere-hálózat azonosítására (metametabolomika)

Mikrobiális források követése

Módszerek gyűjteménye a mikrobák otthoni környezetének értékelésére. Az egyik módszer, a SourceTracker, Bayes-féle megközelítéssel azonosítja a bakteriális taxon minden eredetét, és megbecsüli az egyes közösségek arányát a különböző környezetekből származó baktériumokból.

Egy adott élőhelyet elfoglaló mikrobiális közösség - beleértve a baktériumokat, Archea-t, Eukaryát és vírusokat