Az étrend alkalmazkodása a kutyában az őskori mezőgazdaság - az öröklődés - terjedését tükrözi

öröklődés

  • Tárgyak
  • Összegzés
  • Bevezetés
  • Anyagok és metódusok
  • Minták
  • DNS kivonása
  • Esszé példányszáma
  • A kutyák földrajzi származása.
  • Regionális CNV elemzés
  • Eredmények
  • Variáció Tábornok AMY2B farkasban, aranysakálban, prérifarkasban és kutyában
  • A kutyák példányszámának megoszlása ​​összefügg az őskori mezőgazdaság terjedésével
  • Őshonos kutyák
  • Európai kutyák
  • Vita
  • A példányszámai AMY2B a kutyák háziasítása során megsokszorozza öt
  • A példányszám bővítés AMY2B az összefüggésben áll az őskori mezőgazdaság terjedésével
  • Adatfájl
  • Kiegészítő információk
  • Képfájlok
  • 1. kiegészítő ábra
  • 2. kiegészítő ábra
  • Excel fájlok
  • 1. kiegészítő táblázat
  • 2. kiegészítő táblázat
  • 3. kiegészítő táblázat
  • Word dokumentumok
  • Kiegészítő legendák

Tárgyak

  • Állattenyésztés
  • Evolúciós genetika

Összegzés

Bevezetés

Ha a kutyák étrendje megváltozott az újkőkori forradalom során, akkor valószínűleg nem kapcsolódott a korai háziasításhoz, mivel ez a folyamat valószínűleg a mezőgazdaság fejlődése (10 000–12 000 YBP) előtt kezdődött (11 000–40 000 YBP) (Freedman et al. Al. ., 2014). Hasonlóképpen, bár egy korábbi étrendváltozás összhangban állna a kutya háziasításának mezőgazdasági termelés előtti idejével, az ausztrál dingókban és néhány sarkvidéki kutyában az AMY2B kópiaszám-bővülés hiánya arra is utal, hogy az étrend megváltoztatása nem kapcsolódhatott a kezdeti háziasításhoz, de inkább az emberi létfenntartás későbbi változásához kapcsolódik (Arendt et al., 2014; Freedman et al., 2014).

Annak megértése érdekében, hogy a kutya étrendjének változása hogyan kapcsolódik a háziasítási folyamathoz és az emberi megélhetés változásához, pontos és megbízható DNS-kvantifikációs módszerekkel hajtottuk végre az AMY2B CNV első globális vizsgálatát. Ezáltal megszerezzük az első részletes képet az AMY2B példányszám bővítéséről, amely lehetővé teszi számunkra, hogy regionális kutatások alapján és az alternatív emberi megélhetési stratégiák tükrében tanulmányozzuk a kutyakeményítő alkalmazkodását.

Anyagok és metódusok

Minták

Az AMY2B kópiaszámok eloszlásának részletes elemzésének lehetővé tétele érdekében 221 kutyából gyűjtöttünk bukkális tampont vagy vérmintát, amelyek közül 95 a világ minden tájáról származó őshonos kutyákat képvisel, köztük 25 ausztrál dingót. fajtájú kutyák. Bevettünk 171 kutyát (köztük 19 natív grönlandi kutyát), akiknek korábban az AMY2B kópiaszámok genotípusát (Arendt és mtsai, 2014) használták, ugyanazon módszer alkalmazásával, amelyet ebben a tanulmányban használtak. Összesen 392 kutyát elemeztek, amelyek 96 különböző fajtát és őshonos kutyát képviselnek (1. kiegészítő táblázat). Az AMY2B kópiaszám-bővülés eredetének elemzéséhez elemeztük 5 bolgár arany sakál, 1 prérifarkas (Minnesotából származó) és összesen 51 farkas szövet- vagy vérmintáit Afrikából (n = 1), Horvátországból (9), Észtországból. (8), Izrael (4), Svédország (1), Dánia (1) és az Egyesült Államok (12), valamint a svéd állatkert populációjából származó 15 farkas, akik a balti régió természetes farkasállományából származnak (Svédország, Finnország, Észtország, Lettország és Oroszország) (2. kiegészítő táblázat).

DNS kivonása

A DNS-t kivontuk az EDTA véréből kézi sókivonással vagy QIASymphony DNS Midi kit (Qiagen, Venlo, Hollandia) alkalmazásával a QIASymphony roboton (Qiagen). A DNS-t az izomszövetből DNeasy Blood and Tissue Kit (Qiagen) alkalmazásával extraháltuk. A bukkális kenetmintákat FTA-kártyákon tároltuk, amelyekből a DNS-t ezt követően forrási módszerrel eluáltuk, az alábbiak szerint: először minden egyes FTA-kártya 2-3 szúrását egy csőbe helyeztük és háromszor mostuk 180 ul ddH20-ban; másodszor, az eluálást 25 μl ddH 2O hozzáadásával végeztük minden mintához, és ezt 30 percig 95 ° C-on forraltuk.

Esszé másolat száma

A kutyák földrajzi származása.

Az őshonos kutyákat képviselő 114 egyed származását (az 1. kiegészítő táblázatban „bennszülötteknek” nevezik) a mintavételi helyen állapították meg. Ezeket a kutyákat vidéki régiókból gyűjtötték be, kevés külföldi kutyával, azzal az indokkal, hogy a meglévő kutyák valószínűleg az eredeti populációt képviselik. A fajtatiszta kutyákat a Federation Cynologique International (//www.fci.be) (1. kiegészítő táblázat) szerint földrajzi eredethez rendelték a következő kivételekkel: először Japánban vettek mintát három fajtatiszta kutyából (Kawakami-Dog, Ryukyu és Satsuma-Dog), egyet Kirgizstanban (afgán kopó) és egyet Oroszországban (Stepnaja) a Nemzetközi Kinológiai Szövetség nem ismerte el, de ennek ellenére jól megalapozott helyi státuszuk alapján a származási országot rendelték hozzájuk; Másodsorban az amerikai staffordshire-i terrierek, az új-skotiai kacsa-díjas retrieverek és az ausztrál terrierek Európába soroltak, mivel nemrégiben származnak az európai telepesek által Észak-Amerikában, illetve Ausztráliában alapított társadalmakban.