Omega-3 zsírsavak összetétele atlanti lazacfiléből; Globális akvakultúra-ügyvéd
A genom társulási tanulmány azonosítja a genetikai variánsokat
Az atlanti-óceáni lazac (Salmo salar) fontos tenyésztett halfaj, amely izomában magas az egészséget elősegítő hosszú láncú omega-3 többszörösen telítetlen zsírsavak (omega-3 LC PUFA) tartalmáról, eikozapentaénsav (EPA; 20: 5) omega-3) és dokozahexaénsav (DHA; 22: 6 omega-3). Az omega-3 LC PUFA-k szintje az utóbbi évtizedekben jelentősen csökkent, mivel a tenyésztett atlanti lazac étrendjében a tengeri összetevők nagy részét fenntarthatóbb növényi összetevőkkel helyettesítették. A kvantitatív genetikai elemzések becsülték az atlanti lazac omega-3 zsírsavainak genetikai paramétereit, és megmutatták a szelektív tenyésztés lehetőségét az omega-3 LC PUFA szintjének növelésére a lazacfilékben, mivel ezek örökölhető tulajdonságok.
Számos tanulmány megfigyelte a DHA magasabb szelektív lerakódását az izmokban, mint az étrend többi zsírsavja. Az EPA viszont úgy tűnik, nagyobb mértékben metabolizálódik, mint az izomban a DHA. Csoportunk nemrégiben végzett atlanti lazac-tanulmánya azt találta, hogy az izom EPA-tartalma negatívan kapcsolódik a lipid katabolizmusban szerepet játszó gének expressziójához, és feltételezte, hogy az EPA-tartalomban az egyéni különbségeket a zsírsavak (FA) szelektív oxidációja okozza. Arról azonban kevés ismeret áll rendelkezésre, hogy mely gének és anyagcsere útvonalak a legfontosabbak az atlanti lazac izomzatának EPA- és DHA-tartalmának meghatározásában.
A genom egészére kiterjedő asszociációs vizsgálatok (GWAS) hatékony eszköz, amely képes azonosítani az egyetlen nukleotid polimorfizmust [SNP-k - egyetlen nukleotid (a DNS és az RNS építőkövei) szubsztitúciója, amelyet a genom meghatározott helyzetében állítanak elő (teljes készlet Bármely szervezetből származó DNS)] fenotípusos (megfigyelhető) tulajdonságokkal társított génekhez kapcsolódik. Az izom FA összetétele A GWAS-t szarvasmarhákban és sertésekben végezték, ahol több régiót és jelentősen társult lókuszt azonosítottak. Halak esetében az ázsiai tengeri sügérben (vagy barramundiban, Lates calcarifer) végzett vizsgálat kimutatta a halakban az FA genetikai felépítésének összetettségét.
Az atlanti lazac izom-omega-3 LC PUFA-tartalmának genetikájának megértése érdekében a GWAS egy releváns megközelítés, amelyet még fel kell tárni az atlanti lazacban. Ez a cikk, amelyet a eredeti poszt [Horn S.S. et al. 2020. A GWAS azonosítja az atlanti-óceáni lazacfilé omega-3 zsírsavösszetételével összefüggő genetikai variánsokat.] - beszámol egy tanulmányról, amely azonosítja az atlanti lazac izomjában található hosszú láncú omega-3 zsírsavak tartalmához kapcsolódó genetikai variánsokat a genom egészére kiterjedő asszociációs vizsgálat (GWAS) elvégzésével.
Tanulmány beállítása
Összesen 642 hal 92 férfitól és 194 nőstől került be az elemzésbe. Minden hímnek négy vagy több utódja volt több nősténytől. A halak [egy évosztályú] ívó populációból származnak SalmoBreed AS. A halakat 0,1 kg átlagos tömeggel vitték a tengerbe, és körülbelül 12 hónappal később levágták, átlagos súlyuk 3,6 kg volt (1,2-6,4 kg tartományban). A halakat kereskedelmi tenyészállatokkal etették. Skretting 70% halolajat és 3,1% EPA-t és DHA-t tartalmaz.
Valamennyi halat azonos körülmények között nevelték, és levágás előtt 13–14 napig éheztették. Feláldozás után a nemet vizuálisan meghatároztuk az ivarmirigyek vizsgálatával, feljegyeztük a testtömegét, és vázizom mintákat vettünk lipid és FA elemzés céljából a norvég Quality Cut cégtől; a mintákat összegyűjtöttük, fagyasztottuk és -20 ° C-on tároltuk a különböző elemzésekhez. A halállományról és a feljegyzésekről, az izomzsír- és zsírsav-analízisről, a genotípusokról és a statisztikai elemzésekről részletes információkat az eredeti kiadvány tartalmaz. Ezt a munkát a Norvég Kutatási Tanács támogatta (pályázati szám: NFR 244200).
Eredmények és vita
Ebben a tanulmányban a GWAS-t 642 vágási méretű atlanti lazacon végezték, amelyek az EPA és a DHA tartalmának variációit mutatták. Számos tulajdonságot elemeztek, és a legtöbb tulajdonság nem mutatott szignifikáns valószínűségi értékeket (p-értékeket) a teljes genomra vonatkozóan. Kivételt képeztek a DHA/ALA [a-linolénsav] arány és a DHA/DPA [dokozapentaénsav] arány. Ezért a fő omega-3 LC PUFA-k mellett a két tulajdonságra fókuszáltunk: a DHA-ra és az EPA-ra.